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白粉病菌诱导的卵穗山羊草叶片cDNA文库构建和分析
白粉病菌诱导的卵穗山羊草叶片cDNA文库构建和分析
作者:
付颖
刘新伦
吉万全
张宏
王亚娟
王长有
陈雪燕
原文服务方:
河北农业大学学报
卵穗山羊草
白粉病菌
cDNA文库
摘要:
为了获得卵穗山羊草(Aegilops geniculata Loss)与白粉病抗性相关的基因,本试验构建了白粉菌生理小种E09诱导后的卵穗山羊草12,24,36,48和96 h的苗期叶片混合cDNA文库.从文库中随机挑取阳性克隆经PCR检测,测序后利用DNAStar软件对所获EST序列进行聚类拼接,得到409个EST序列,在聚类结果中,EST序列的片段大小在205~1 574 bp之间,平均为536 bp;409条EST序列中,44(10.76%)条未找到同源性的蛋白序列,365(89.44%)条找到同源性较高的蛋白序列,其中307条已知蛋白功能;对已知功能的序列运用Pathway软件进行功能分类,主要涉及细胞进程34条(8.31%)、环境信息55条(13.45%)、抗病防御46条(11.25%)、遗传信息33条(8.07%)、新陈代谢127条(31.05%)、生物有机体12条(2.93%)和假定蛋白58条(14.18%).这些EST序列为卵穗山羊草白粉病抗性相关基因的获得和抗病机制的研究奠定了基础.
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文献信息
篇名
白粉病菌诱导的卵穗山羊草叶片cDNA文库构建和分析
来源期刊
河北农业大学学报
学科
关键词
卵穗山羊草
白粉病菌
cDNA文库
年,卷(期)
2015,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1-6
页数
6页
分类号
S519
字数
语种
中文
DOI
10.13320/j.cnki.jauh.2015.0126
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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白粉病菌
cDNA文库
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
河北农业大学学报
主办单位:
河北农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-1573
CN:
13-1076/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1959-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
3463
总下载数(次)
0
总被引数(次)
35752
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
陕西省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Basic Research Plan in Shaanxi Province of China
官方网址:
项目类型:
学科类型:
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