闪烁古生球菌基因中密码对的偏好性

• 作者: 王志坚 王芳平
• 来源期刊: 中国医学物理学杂志
• 关键词: 基因组 密码对 紧邻密码子 同义密码子
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 医学生理物理与临床应用
• 页码范围: 2934-2936,2944
• 分类号: Q61
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-202X.2011.05.026

摘要

目的:如同密码子的偏爱性使用一样,密码对的使用也有偏爱性,为了揭示基因组中密码对使用的规律,对闪烁古生球菌基因组中密码子及其紧邻密码子(密码子对)偏爱分布作较全面的统计分析.方法:生物统计学.结果:通过定义密码对的相对丰度,发现81%的密码子对其紧邻密码子有偏爱性,这种偏爱性与同义密码子的使用有关.此外,通过密码子及其紧邻密码子与全序列六联体的相对丰度比较发现,大约30%的紧邻密码对偏爱性不能用基因组的序列组分来解释.结论:密码对的偏爱性与它的核苷酸组分有显著相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王志坚	天水师范学院物理与信息科学学院物理系	23	36	4.0	4.0
2	王芳平	天水师范学院物理与信息科学学院物理系	8	5	1.0	1.0