长江华溪蟹β-actin基因cDNA扩增及分子系统发育初步分析

• 作者: 王兰 袁慧 高爱保
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 长江华溪蟹 β-肌动蛋白 反转录PCR 分子系统发育
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 173-178
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

利用RT-PCR技术,扩增了长江华溪蟹(Sinopotamon yangtsekiense)β-actin基因片段,测序并结合GenBank数据库中蓝蟹(Callinectes sapidus)、中华绒螯蟹(E.sinensis)、黑背地蟹(Gecarcinus lateralis)、张口蟹(Neohelice granulata)、远海梭子蟹(Portunus pelagicus)、锯缘青蟹(Scylla serrata)6种蟹的同源序列进行比较.结果显示:在长为338 bp的β-actin同源序列中有115个变异位点,57个单碱基变化位点.7种蟹的种间核苷酸变异值从1.6%到25.3%,碱基替换比值从0.740到4.050,其中锯缘青蟹和远海梭子蟹亲缘关系很近,长江华溪蟹和地蟹、张口蟹亲缘关系较远,而中华绒螯蟹和远海梭子蟹关系较远.用NJ法和ML法构建了分子系统树,得到了相同的拓扑结构.系统发育分析表明长江华溪蟹单独形成一支,与其它海洋蟹的亲缘关系远,支持溪蟹单独划分总科.锯缘青蟹和远海梭子蟹先聚在一起,然后和黑背地蟹聚在一起,再和弓蟹科的张口蟹聚在一起,与传统形态学分类系统稍有不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王兰	山西大学生命科学院	123	1118	16.0	28.0
2	高爱保	山西大学生命科学院	2	9	2.0	2.0
6	袁慧	山西大学生命科学院	2	31	2.0	2.0