柱状黄杆菌乙酰辅酶A合成酶基因及其上游调控序列分析

• 作者: 姚卫建 张金 聂品 邹红
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 柱状黄杆菌 乙酰辅酶A合成酶基因 启动子 核糖体结合位点
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1100-1107
• 分类号: S941
• 字数: 5096字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.01100

摘要

柱状黄杆菌(Flavobacterium columnare)是世界范围内危害淡水鱼类的柱形病的病原.目前对该病原菌遗传操作系统的研究进展较慢,而寻找高效稳定的启动子来调控外源基因在细菌体内的表达,有可能促进该细菌遗传操作系统的构建.本研究获得了柱状黄杆菌乙酰辅酶A合成酶基因(acetyl-coenzyme A synthetase gene,acs)的编码序列及其上游调控序列,该基因全长2 323 bp,编码635个氨基酸.通过序列分析,发现在该基因起始密码子ATG的上游存在核糖体结合位点(ribosome biding site,RBS)序列TAAAA,和启动子-7和-33的保守基序TATTTTCG和TTG.将acs的上游调控序列(promoter sequence,Pacs)置于氯霉素抗性基因(chloramphenicol acetyltransferase,cat)的上游并导入柱状黄杆菌G4株后,cat基因得以表达,并使宿主细胞产生稳定的氯霉素抗性.通过5'RACE技术,确定了外源的cat基因和内源的acs基因的转录起始位点都是位于起始密码子上游46 bp处的T.通过删减分析调控序列Pacs,发现起始密码子上游164 bp的序列是保持启动子活性所必需的.通过分析和比对32个基因的核糖体结合位点区域,在起始密码子上游10 bp处发现了RBS保守基序TAAAA.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	聂品	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	65	861	13.0	28.0
2	姚卫建	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	37	263	10.0	15.0
3	邹红	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	6	58	5.0	6.0
4	张金	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	4	46	2.0	4.0