海参纲线粒体基因组特征分析及分子标记探讨

• 作者: 任建峰 孟学平 田美 申欣 程汉良
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 海参纲 线粒体基因组 基因排列 分子标记
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 400-404
• 分类号: Q78
• 字数: 3431字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1111.2011.07.007

摘要

通过常规PCR和长PCR扩增获得仿刺参的线粒体DNA,进而采用鸟枪法测序、序列拼接获得仿刺参的线粒体基因组全序列.结合瓜参、拟刺参、海参及另外一个仿刺参的线粒体基因组,初步揭示了海参纲线粒体基因组的基本特征.檐手目的3个物种(仿刺参、拟刺参和海参)线粒体基因组的基因排列完全一致,且与海胆纲物种线粒体基因组的基因排列相同.隶属于枝手目的瓜参线粒体基因组的基因排列与其他海参线粒体基因组相比,发生6个tRNA基因的易位.海参纲线粒体基因组主编码基因的变异特征分析揭示了在海参类线粒体基因组所有的主编码基因中,coxl基因多态位点的比例最低,仅为29.46%;nad2、nad4、nad5三个基因的多态位点不仅比例较高,而且基因的长度较长,从而拥有最多的多态位点.因此,nad2、nad4和nad5基因可以coxl基因辅助的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申欣	淮海工学院海洋学院	37	175	8.0	11.0
5	田美	淮海工学院海洋学院	24	134	7.0	10.0
6	孟学平	淮海工学院海洋学院	46	339	11.0	15.0
7	程汉良	淮海工学院海洋学院	62	727	14.0	24.0
8	任建峰	中国科学院海洋研究所	4	15	2.0	3.0