褐斜鲽(Plagiopsetta glossa)线粒体基因组特征及重排机制研究

• 作者: 孔晓瑜 时伟 董江星 陈世喜
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 鲽形目 冠鲽科 线粒体基因组 基因重排 分子进化
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 海洋生物学
• 页码范围: 1-11
• 页数: 11页
• 分类号: P735.541
• 语种: 中文
• DOI: 10.11978/2017041

摘要

冠鲽科(Samaridae)隶属于鲽形目(Pleuronectiformes),包含冠鲽属(Samaris)、沙鲽属(Samariscus)和斜鲽属(Plagiopsetta).目前研究表明, 冠鲽(Samaris cristatus)和满月沙鲽(Samariscus latus)的线粒体基因组结构都有重排, 并且两者的基因数量也有差别.为检测斜鲽属鱼类中是否也有不同的特征结构, 我们选用褐斜鲽(Plagiopsetta glossa)作为代表种进行斜鲽属鱼类线粒体基因组特征分析, 同时与冠鲽属及沙鲽属鱼类的线粒体基因组特征进行对比.分析显示, 褐斜鲽的线粒体基因组全长为18723bp, 包括39个基因: 13个蛋白基因、24个tRNA基因、2个rRNA基因、2个控制区、1个轻链复制起点和比典型基因组多的13个间隔子.和经典鱼类的线粒体基因组相比, 褐斜鲽和满月沙鲽都多了tRNA-Cys 和 tRNA-Tyr 两个 tRNA,冠鲽只多了 tRNA-Cys,且 3 个种类都多了一个控制区,但褐斜鲽与满月沙鲽的基因排列顺序相同.褐斜鲽线粒体基因的重排导致不同位置的 6 个 tRNA 形成了六连体基因簇"tRNA-Cys1-Tyr1-Ser1-Lys-Arg-Ser2","ND5-ND6-Glu-Cytb-Thr"则位于六连体之后,但这11个基因相对的排序没有发生变化.采用双复制随机丢失模型(double replications and random loss, DRRL)对褐斜鲽基因的重排现象进行分析, 认为该鱼类基因数量、排列顺序以及比典型基因组多13个间隔子等特征为该模型提供了新的依据.