埃及伊蚊、冈比亚按蚊和致倦库蚊polyUBQ基因的电子克隆及其序列分析

• 作者: 凤舞剑 周保亚 强承魁 王胜永 苏新林 赵虎
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 埃及伊蚊 冈比亚按蚊 致倦库蚊 polyUBQ基因 电子克隆
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 126-130,178
• 分类号: Q96
• 字数: 4075字
• 语种: 中文

摘要

针对具有选择性蛋白质降解功能的泛素在调控昆虫生长发育过程中的重要作用,探讨埃及伊蚊、冈比亚按蚊和致倦库蚊基因组中polyUBQ基因的有关生物信息.采用电子克隆的方法钓取3种蚊虫基因组中polyUBQ基因序列,分析其特征、分子进化关系、遗传多态性和密码子偏爱性.结果显示,成功获取埃及伊蚊、冈比亚按蚊和致倦库蚊polyUBQ基因序列,命名为Aa-polyUBQ(GenBank登录号:AAGE02005963)、Ag-polyUBQ(ABKP02009650)和Cq-polyUBQ(AAWU01023041),分别编码1065个、218个和533个氨基酸残基,各具14个、3个和7个泛素单体,Aa-polyUBQ、Ag-polyUBQ和Cq-polyUBQ蛋白二级结构主要元件是延伸带和无规则卷曲,Leu、Ile和Lys是构成3种蛋白的主要氨基酸,亚细胞主要定位于细胞质和细胞核,无前导肽、信号肽和跨膜结构域,除Ag-polyUBQ蛋白外均呈碱性;3种基因序列的同源性较高(83.8%-88.2%)且遗传距离较近(0.129-0.187);检出135个多态位点,共生成3个单倍型,单倍型多样性(Hd=1.000)、平均核苷酸差异数(K=96.000)、核苷酸多样性(Pi=0.14679)、SS核苷酸多样性均值(Pi(s)=0.57731)、NSS核苷酸多样性均值(Pi(a)=0.01627)、密码子有效值(ENC=29.432-34.321<61)、偏爱指标(CBI=0.672-0.750>0)和X2检验计算(X2=0.977-1.092)显示3种polyUBQ基因间遗传多样性较丰富且呈现较强的密码子偏爱性.Aa-polyUBQ、Ag-polyUBQ和Cq-polyUBQ基因的成功电子克隆及丰富的遗传多态性和较强的密码子偏爱性可为进一步开展其分子进化机制、表达特性和昆虫病毒侵染关系等方面的试验研究提供基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	强承魁	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	45	49	4.0	5.0
2	凤舞剑	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	87	133	6.0	8.0
3	王胜永	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	21	35	4.0	5.0
4	赵虎	徐州生物工程职业技术学院教务处	21	66	5.0	7.0
5	苏新林	徐州生物工程职业技术学院教务处	10	41	4.0	6.0
6	周保亚	徐州生物工程职业技术学院农林工程系	12	25	3.0	4.0