凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因克隆、序列分析及结构预测

• 作者: 彭金霞 李咏梅 熊建华 盛小伟 陈晓汉 高永华
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 凡纳滨对虾 差减cDNA文库 Ufm1基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 192-196
• 分类号: S945.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2011.02.021

摘要

[目的]了解类泛素折叠修饰蛋白(Ufm1)的结构特征和蛋白功能,为进一步探究Ufm1基因功能提供参考.[方法]以同一生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织为材料,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,通过斑点杂交筛选获得Ufm1基因,经全长cDNA文库筛选获得Ufm1基因全长序列.[结果]Ufm1基因全长cDNA序列长714 bp,包含261 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为86个氨基酸,预测的分子量为9.3 ku,等电点pI为6.55;其编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,可能定位于细胞质中,属于亲水性蛋白,含有1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点;序列同源性分析表明,不同进化地位物种的Ufm1基因存在较高的同源性.[结论]Ufm1基因在系统进化上高度保守,这为进一步探究Ufm1基因功能及原核表达等奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈晓汉	广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心	62	510	10.0	20.0
2	李咏梅	广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心	39	319	10.0	16.0
3	高永华	广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心	5	14	3.0	3.0
5	盛小伟	广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心	3	8	2.0	2.0
11	彭金霞	广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心	6	8	2.0	2.0