貂阿留申病病毒结构蛋白VP1基因分子特征分析

• 作者: 姜平 张瑞 李艳伍 袁文泽 贾赟
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 貂阿留申病毒 结构蛋白 特征分析
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 42-47
• 分类号: S852.659.2|S858.92
• 字数: 5779字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2011.04.021

摘要

目的研究貂阿留申病病毒(ADV)结构蛋白VP1基因分子空间结构特征,探讨貂阿留申病病毒致病机制.方法根据Genbank公布的全基因序列设计三对引物,PCR扩增并克隆到pMD-18T载体,阳性重组质粒鉴定、测序验证,拼接后进行生物信息学分析.结果获得了全长2064 bp VP1基因,编码688个氨基酸;与细小病毒属中PPV-Nanjing00801相似性最大(51.2%);遗传进化树显示该基因编码蛋白与细小病毒属VP1亲缘关系最近.该蛋白是一种保守不含信号肽的外膜蛋白,具有7个潜在的N-糖基化位点和34个磷酸化位点.二级结构分析显示无规则卷曲含量最高,达68.75%,α螺旋、β折叠分别为16.42%和14.83%;同源建模比对,构建了具有较高合理性和可靠性的三维空间结构.结论预测抗原表位主要位于肽链第254～265、96～112、317～348、514～523、629～645位区段,可为今后开展基因工程疫苗研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜平	南京农业大学动物医学院	186	1921	25.0	35.0
2	贾赟		33	159	7.0	11.0
3	袁文泽		11	70	5.0	8.0
4	张瑞	河南农业大学牧医工程学院	14	71	5.0	8.0
5	李艳伍	南京农业大学动物医学院	5	29	3.0	5.0