貉源阿留申病毒VP2和NS1蛋白的抗原性预测

• 作者: 丛丽 吴艳虹 岳志刚 章秀婷 肖家美 赵永强 邵西群 韦韬
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 阿留申病毒 VP2蛋白 NS1蛋白 抗原表位 翻译后修饰位点
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1399-1407
• 页数: 9页
• 分类号: S852.659.2
• 字数: 5642字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.06.023

摘要

旨在预测和分析貉源阿留申病毒(RFAV)VP2和NS1蛋白的抗原表位特征,筛选阿留申病毒属较保守的B、T细胞抗原表位.本研究对RFAV的近全长基因组进行克隆及测序,对其VP2和NS1基因编码蛋白的理化性质、二级结构、翻译后修饰位点和抗原表位进行预测,并将预测的修饰位点、抗原表位与其他阿留申病毒种的序列进行比较分析,筛选相对保守的修饰位点和抗原表位.结果 显示,获得的RFAV基因组长4 327 bp,编码VP2蛋白的636个氨基酸,编码NS1蛋白的641个氨基酸.VP2和NS1蛋白均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主.在阿留申病毒属内,VP2蛋白有3个保守的B细胞抗原表位,3个保守的T细胞表位,8个保守的翻译后修饰位点;NS1蛋白有1个保守的B细胞抗原表位,2个保守的T细胞抗原表位和7个保守的翻译后修饰位点.本研究成功克隆了RFAV近全长基因组序列,全面对RFAV的VP2、NS1蛋白抗原表位、翻译后修饰位点进行预测,并分析其在阿留申病毒属内的保守和变异特征,为阿留申病毒免疫研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵西群	中国农业科学院特产研究所	19	49	5.0	6.0
2	章秀婷	中国农业科学院特产研究所	7	19	2.0	4.0
3	韦韬	中国农业科学院特产研究所	9	17	2.0	4.0
4	丛丽	中国农业科学院特产研究所	11	56	4.0	7.0
5	赵永强	中国农业科学院特产研究所	9	21	3.0	4.0
6	肖家美	中国农业科学院特产研究所	27	47	4.0	6.0
7	岳志刚	中国农业科学院特产研究所	21	40	4.0	6.0
8	吴艳虹	中国农业科学院特产研究所	5	0	0.0	0.0