基于EST-SSR的广东与广西茶树资源遗传结构和遗传分化比较分析

• 作者: 乔婷婷 乔小燕 周炎花 姚明哲 金基强 陈亮 马春雷
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 白毛茶 遗传多样性 遗传结构 遗传分化
• 年，卷（期）: 2011,（16）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 3297-3311
• 分类号: S571.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.16.002

摘要

[目的] 通过揭示茶树资源遗传多样性、遗传结构和遗传分化关系,为资源的有效保护和充分利用提供理论依据.[方法] 利用109对核心EST-SSR标记对广东、广西的105份茶树核心资源进行遗传多样性和遗传分化比较分析;同时对广东和广西资源组群间、组群内白毛茶和茶种群同、种群内进行AMOVA分子方差分析,进一步剖析遗传结构,并绘制群体遗传结构图.[结果] 109对核心EST-SSR标记共检测到435个等位基因,平均等位基因(NA) 3.99个,平均有效等位基因(NE)为2.12,平均Nei's基因多样性(H)为0.59,平均观测杂合度(H0)为0.32,平均期望杂合度(He)为0.46,平均多态性信息含量(PIC)为0.56.广东茶树资源遗传多样性的上述6个参数均小于广西茶树资源.广东白毛茶NA和H低于广东茶,NE、He、H0和PIC与茶较为接近;广西白毛茶NA大于广西茶,但是NE、H0和H低于茶.F-统计量分析表明白毛茶与茶种群内近交系数(Fis)、种群间近交系数(Fit)和种群遗传分化(Fst)都较低,基因流(Ns)都较高.广东白毛茶与广西白毛茶Fst为0.04,基因交流相对较低为6.26.AMOVA分析显示组群间遗传变异为3.09％,组群内种群间遗传变异为2.22％,种群内遗传变异为94.69％.群体遗传结构显示105份茶树资源可分为3个类群,类群Ⅰ由6份选育品种组成;类群Ⅱ由43份广东资源和16份广西资源组成;类群Ⅲ包括广西36份和广东4份资源.[结论] 广东茶树资源遗传多样性程度低于广西.广东白毛茶遗传多样性比广东茶丰富,种群遗传分化低,存在较频繁的基因交流.广东白毛茶遗传多样性低于广西白毛茶,遗传分化相对较高,基因流较低.AMOVA分析显示遗传变异主要分布于广东、广西茶树资源群体内.