奶牛瘤胃微生物BAC文库中ACCase基因的筛选与生物信息学分析

• 作者: 刘开朗 卜登攀 周凌云 朱雅新 王加启 赵圣国
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 瘤胃微生物 BAC文库 乙酰CoA羧化酶 基因注释 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 1015-1021
• 分类号: S852.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.05.019

摘要

[目的]从奶牛瘤胃微生物BAC文库中筛选含乙酰CoA羧化酶(ACCase)基因的克隆子,并对其全长测序和生物信息学分析.[方法]利用PCR序列驱动筛选法,从瘤胃微生物BAC文库中筛选ACCase基因,鸟枪法测定基因序列后,进行基因注释、比对和系统发育分析.[结果]筛选得到了含ACCase基因的克隆(U12),其插入片段序列(URE12)全长43358bp,GC含量为43.75%,经GeneMark程序预测含有38个基因,经Signature程序预测属于变形菌门.ACCase基因(Acc-32)编码159个氨基酸,与Elusimicroblum ominutum的ACCase基因具有41%的相似度,编码蛋白分子量为17.89kD,等电点为5.27,在距离Acc-32上游的33 kb区域,发现一段能编码ACCase连接酶的基因.Acc-32的结合位点氨基酸残基为GQVICVIEAMKVFNELKA,系统发育分析表明Acc-32属于-ε变形菌纲.[结论]得到了含有ACCase基因的序列片段,并且ACCase基因具有新的结构特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王加启	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所励物营养学国家重点实验室	304	3565	32.0	47.0
2	卜登攀	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所励物营养学国家重点实验室	149	1229	19.0	29.0
3	朱雅新	中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室	8	94	4.0	8.0
4	赵圣国	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所励物营养学国家重点实验室	27	109	6.0	10.0
5	刘开朗	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所励物营养学国家重点实验室	19	273	7.0	16.0