用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析

• 作者: 李晓静 王惠聪 胡桂兵 胡福初 赖彪 魏永赞
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 荔枝 qPCR 内参基因 克隆 稳定性分析
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 农学·园艺·土壤肥料
• 页码范围: 301-306
• 分类号: S667.1
• 字数: 3997字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-411X.2012.03.006

摘要

利用基因克隆和测序,从‘妃子笑’荔枝果皮中获得了β-Actin、GAPDH和18S rRNA 3个qPCR分析常用的内参基因全长序列,其长度分别为1 273、1368和1712 bp;3个基因与其他物种高度同源,氨基酸序列相似性均超过了98％.在此基础上,结合已报道的UBQ、eEF和25S rRNA 3个常用的内参基因,对β-Actin、GAPDH、18S rRNA,UBQ、eEF和25S rRNA 6个常用内参基因在荔枝果实发育不同阶段和外源生长调节剂处理后表达稳定性进行了分析,同时比较了geNorm、NormFinder和BestKeeper 3种不同算法的差异.结果表明:以上6个基因中,β-Actin基因在3种不同算法下均保持了较好的表达稳定性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡桂兵	华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室	106	1636	19.0	38.0
2	胡福初	华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室	16	58	5.0	7.0
4	赖彪	华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室	4	24	2.0	4.0
5	魏永赞	华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室	22	85	5.0	8.0
11	李晓静	华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室	2	25	2.0	2.0