胡子鲇Dmrt1基因全长cDNA克隆及其表达分析

• 作者: 吴天利 朱春华 李广丽 王静杰 邓思平
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 胡子鲇 Dmrt1 DM结构域 精子发生 表达分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 610-617
• 分类号: Q781
• 字数: 6214字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2012.00610

摘要

以胡子鲇(Clarias fuscus)为研究对象,利用RT-PCR技术和SMART RACE技术克隆获得Dmrt1基因cDNA全长,并利用生物信息学分析其结构及功能;利用半定量RT-PCR技术检测胡子鲇性腺(精巢/卵巢)、肌肉、肠、肝脏、心脏、头肾、鳃丝、脑和眼等10种组织以及Ⅱ-Ⅴ期精巢中Dmrt1基因表达.结果表明:胡子鲇Dmrt1基因cDNA全长为1417 bp,其中5′非编码区(5′-UTR)为35 bp,3′非编码区(3′-UTR)为516 bp,开放阅读框(ORF)包含864 bp,编码287个氨基酸(aa),预测所编码DMRT1为主要位于细胞核内的不稳定性亲水蛋白.氨基酸序列比对显示,胡子鲇DMRT1与已公布的非洲胡子鲇、蟾胡子鲇、黄颡鱼等鲇形目鱼类的相似性为83.3％-96.1％.胡子鲇DMRT1中具有DMRT基因家族共有的、保守性很高的DM结构域,此结构域具有典型的“C2H2C4”锌指结构,与上述鲇形目鱼类的相似性达100％,与斑马鱼、青鳉、虹鳟等鱼类的相似性为91.9％-97.3％,而与鸡、鼠、猪人等的相似性达80％以上.组织表达显示,胡子鲇Dmrt1基因仅在精巢中表达,且II期精巢(即精子发生期)中Dmrt1基因表达量显著高于Ⅲ、Ⅳ和V期精巢(P＜0.05),而卵巢及其他8种组织中均无表达,表明Dmrt1是胡子鲇精巢特异性表达基因,可能与胡子鲇的雄性性别决定、精子发生及精巢发育密切相关.