应用dsRNA测序技术检测草鱼呼肠孤病毒的混合感染

• 作者: 吕利群 王土 许丹
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: dsRNA测序 检测 草鱼呼肠孤病毒 混合感染
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 水生生物疾病与防治
• 页码范围: 756-762
• 分类号: S917|S941.41
• 语种: 中文

摘要

从草鱼（Ctenopharyngodon idellus）出血病疑似病料提取物感染的草鱼肾细胞（CIK）中提取病毒基因组dsRNA,电泳显示出水生呼肠孤病毒基因组的典型特征。应用简化的FLAC（full-length amplification of cDNA）技术扩增得到病毒的4个全长基因组片段进行测序分析。核酸序列BLAST分析表明：其中3个基因组片段与GCRV-873第5、9、10片段高度同源,另外1个基因组片段与GCRV-HZ08第11片段高度同源;因此推测病料中同时存在两种不同的病毒核酸,但也可能存在一种杂合病毒。根据已发表的GCRV-HZ08第5、9、10片段设计了3对引物对分离的病毒总RNA进行RT-PCR检测并测序,结果显示这3个片段与GCRV-HZ08第5、9、10片段均具有99%同源性,表明是由于混合感染而存在两株不同病毒的核酸dsRNA,两株病毒分别命名为GCRV-JX01和GCRV-JX02。首次运用dsRNA测序法检测出了GCRV病毒的混合感染,为草鱼呼肠孤病毒的流行病学和防控提供了一种新的技术选择。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许丹	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	28	100	6.0	9.0
2	吕利群	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	30	150	7.0	11.0
3	王土	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	14	1.0	1.0