甘肃西峰黄土中细菌16S rDNA文库的构建与组成初步分析

• 作者: 季峻峰 崔益斌 潘雪莲 陈旸* 陈骏 黄晟
• 来源期刊: 高校地质学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 黄土 16S rDNA文库 细菌多样性 酸杆菌
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 765-772
• 分类号: P539.2
• 字数: 5678字
• 语种: 中文

摘要

对黄土高原西峰地区黄土沉积物中的有机质进行了总DNA提取和PCR(聚合酶链式反应)扩增,通过克隆测序技术构建了含有44个克隆子的细菌16S rDNA文库.对16S rDNA系统发育的分析表明,西峰地区的黄土沉积物中细菌可分属13个类群,包括:酸杆菌(Acidobacteria)、变形菌(Proteobacteria)、放线菌(Actinobacteria)、绿弯菌(Chloroflexi)、厚壁菌(Firmicutes)、疣微菌(Verrucomicrobia)、浮霉菌(Planctomycetes)、芽单胞菌(Gemmatimonadetes)、异常球菌—栖热菌(Deinococcus-Thermus)、硝化螺旋菌(Nitrospirae)、蓝细菌(Cyanobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes)和Candidate division TG1.其中酸杆菌为最主要优势类群,变形菌为次优势类群,二者占黄土细菌总克隆数的70%,且大多为不可培养的基因型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	季峻峰	表生地球化学教育部重点实验室南京大学地球科学与工程学院	10	33	4.0	5.0
2	崔益斌	污染控制与资源化研究国家重点实验室南京大学环境学院	3	49	3.0	3.0
3	黄晟	表生地球化学教育部重点实验室南京大学地球科学与工程学院	1	4	1.0	1.0
4	陈旸*	表生地球化学教育部重点实验室南京大学地球科学与工程学院	1	4	1.0	1.0
5	潘雪莲	污染控制与资源化研究国家重点实验室南京大学环境学院	1	4	1.0	1.0