微小隐孢子虫含EF-hand结构域蛋白家族的生物信息学研究

• 作者: 付芹芹 周天鸿 孙小会 李月琴 杨光 王穗湘 荆春霞 郭志云
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 微小隐孢子虫 EF-hand结构域 Ca2+ 生物信息学分析 功能预测
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 653-658,663
• 分类号: R382.3
• 字数: 5669字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2012.07.002

摘要

目的 对微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum,Cp)含EF-hand结构域家族蛋白进行生物信息学研究,探讨该家族蛋白的EF-hand结构域与Ca2+信号的关系以预测该家族蛋白的功能,为隐孢子虫病的诊断和治疗提供新的方向.方法 首先通过数据收集,获得EF-hand结构域家族蛋白的序列信息,接着对每个蛋白进行CDD结构域搜索和NCBI BLAST 的比对分析,确证为EF-hand结构域家族蛋白,最后进行结构域分析和功能预测.结果 搜索到了C.parvum Iowa Ⅱ中18个含有EF-hand结构域的蛋白,它们之间的氨基酸长度,分子量大小以及等电点等都有很大的区别,通过结构域分析把EF-hand家族分成了含一个EF-hand结构域、二个EF-hand结构域、同时含EF-hand和STKc-AGC两种结构域和同时含EF-hand和PKC两种结构域四大类.结论 EF-hand结构域蛋白家族与重要的钙离子信号作用有着密切的关系,而C.parvum对宿主细胞的侵袭能力与胞内的Ca2+水平密切相关,所以EF-hand蛋白家族很有可能成为隐孢子虫病治疗的一个新的突破点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李月琴	暨南大学生命科学技术学院	81	309	10.0	13.0
2	杨光	暨南大学医学院	31	186	8.0	13.0
3	荆春霞	暨南大学医学院	91	1611	22.0	37.0
4	周天鸿	暨南大学生命科学技术学院	130	517	10.0	16.0
5	付芹芹	暨南大学医学院	8	32	2.0	5.0
6	郭志云	暨南大学医学院	7	7	1.0	1.0
7	孙小会	暨南大学医学院	6	7	1.0	1.0
8	王穗湘	暨南大学医学院	8	15	2.0	3.0