凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组 Solexa 测序及其初步分析

• 作者: 严雪平 刘斌 袁剑波
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 肠道微生物宏基因组 CTAB Solexa 测序
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 页码范围: 9-14
• 分类号: Q89
• 语种: 中文

摘要

CTAB-酚/氯仿法提取新鲜凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肠道微生物宏基因组 DNA.结果表明: CTAB-酚/氯仿法提取总 DNA 的浓度达到92.5 ng/μL,半定量 PCR 法检测微生物基因组相对含量为69.9%.凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组用于 Solexa 测序,生物信息学分析结果显示宏基因数据中64.1%的数据属于未知序列,35.5%属于真核生物,而已知的微生物和病毒序列所占比例仅有0.4%

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘斌	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	230	3876	32.0	56.0
2	严雪平	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	1	7	1.0	1.0
3	袁剑波	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	2	10	2.0	2.0