HIV辅助受体CCR5常见小分子抑制剂抑制效果的综合评价

• 作者: 何淼 焦诗卉
• 来源期刊: 中山大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: discovery studio CCR5 HIV-1 小分子抑制剂
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 页码范围: 97-102
• 页数: 6页
• 分类号: Q354
• 字数: 4161字
• 语种: 中文

摘要

通过系统比较CCR5常见小分子抑制剂的抑制效果,寻找CCR5的优化对接靶点,筛选最优抑制剂,为新型抑制剂的研发提供理论依据.基于Material Studio软件,我们构建了7类29种小分子抑制剂的三维结构,全面模拟了各种抑制剂与CCR5对接的效果;利用分子对接绝对自由能、相对自由能、对接姿态百分比和LibDock综合得分等参数评估小分子抑制剂的抑制效果.研究初步发现,CCR5小分子抑制剂的最优对接位点是第二个胞外环与N末端之间的site4.小分子抑制剂的抑制效果由强到弱排序依次为:抑制剂27(吡咯烷类)、抑制剂8(苯并环庚烯类)、抑制剂12(哌啶类)、抑制剂14(螺环二酮哌啶类)、抑制剂21(4-哌啶-1-丁胺类)、抑制剂5(天然小分子类)和抑制剂17(托品烷类);其研究表明,吡咯烷类抑制剂27可能成为CCR5最优抑制剂候选对象.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何淼	中山大学生命科学学院	24	152	7.0	11.0
2	焦诗卉	中山大学生命科学学院	3	12	1.0	3.0