引入显式水分子对接提高蛋白质配体复合物结构的预测精度

• 作者: 吕强 吴宏杰 徐维维 权丽君
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水分子 空间占据 氢键 蛋白质-配体对接
• 年，卷（期）: 2012,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 983-997,1022
• 页数: 16页
• 分类号: Q61
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2012.20116

摘要

在蛋白质复合物界面一般都会存在着一定量的水分子,这些水分子通过空间占据和氢键方式影响蛋白质与配体的位置关系.应用现有的计算机方法研究蛋白质-配体对接对,一般不会显式地考虑水分子的作用.本文显式地将水分子引入蛋白质-配体对接过程,考虑水分子空间占据和氢键能量对复合物对接结构的影响,提出了一种包含水分子的蛋白质-配体对接算法.实验结果表明引入水分子使蛋白质-配体对接质量有明显提高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕强		134	1011	15.0	26.0
2	吴宏杰		12	35	4.0	4.0
3	徐维维		2	0	0.0	0.0
4	权丽君		3	0	0.0	0.0