申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白的结构分析与功能预测

• 作者: 孙九峰 张晓辉 张静 袁立燕 赵静 钟毅 黄怀球
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 申克孢子丝菌 翻译控制肿瘤蛋白(TCTP) 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 454-459
• 分类号: R379.9
• 字数: 4081字
• 语种: 中文

摘要

[目的]从cDNA文库中识别申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)的基因并分析预测其结构功能和应用前景.[方法]利用NCBI和ExPASy网站中的各种基因和蛋白的序列结构信息分析工具,结合DNAstar和VectorNTI suite生物信息学分析软件包,从申克孢子丝菌全长cDNA质粒文库中识别TCTP的基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白结构特征和功能.[结果]TCTP基因全长621 bp,编码区具有207个氨基酸.在GenBank同源序列中,其与蓝菌属真菌(Grosmannia clavigera)TCTP氨基酸序列一致性达到78％.理论预测分子质量为64581.4 ku.无质体和线粒体定位序列.预测结果显示编码蛋白含有1个跨膜区、7个亲水性部位和5个主要B细胞表位.与蓝菌属真菌及球毛壳霉(C.globosum)的TCTP进化关系最近.[结论]应用生物信息方法筛选出申克孢子丝菌TCTP的cDNA全长序列并预测其结构与功能、潜在抗原表位,为进一步实验研究该蛋白生物学特性提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄怀球	中山大学附属第三医院皮肤性病科	81	406	10.0	17.0
2	赵静	中山大学附属第三医院皮肤性病科	71	268	9.0	14.0
3	钟毅	中山大学附属第三医院皮肤性病科	10	45	2.0	6.0
4	袁立燕	中山大学附属第三医院皮肤性病科	8	12	2.0	2.0
5	张静	中山大学附属孙逸仙纪念医院皮肤性病科	58	216	8.0	11.0
6	张晓辉		16	42	3.0	6.0
7	孙九峰	中山大学中山医学院热带病防治研究教育部重点实验室	5	13	2.0	3.0