申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析

• 作者: 吴晓雁 吴榕 孙瑶 张静 陈三妹 高文超 黄家敏 黄怀球 黄晓雯
• 来源期刊: 皮肤性病诊疗学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 申克孢子丝菌 对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 79-82,88
• 页数: 5页
• 分类号: R379
• 字数: 3049字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8468.2020.02.003

摘要

目的:初步预测及分析申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,Ss.)对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因(4Hppd)编码蛋白的结构和生物学功能特征.方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss.4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征.结果:Ss.4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52.0 kD,等电点为5.98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中.其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度.结论:预测Ss.4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考.