申克孢子丝菌SPDS基因的生物信息学分析及分子克隆

• 作者: 冯佩英 张晓辉 张静 李玉哲 袁立燕 高文超 黄丽林 黄怀球
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 申克孢子丝菌 亚精胺合成酶 生物信息学 分子克隆
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 信息研究
• 页码范围: 948-953
• 页数: 6页
• 分类号: R75
• 字数: 3563字
• 语种: 中文

摘要

[目的]分析预测申克孢子丝菌cDNA中编号为Locus_ 168_Contig_1序列编码的基因及蛋白质结构、功能特征,并进行分子克隆.[方法]利用NCBI及Expasy网站提供的BLASTx、SignalIP、InterPro Scan等生物信息学软件分析其序列,判断其是否为全长编码序列、同源序列名称,并分析其结构、定位及功能等;将其中的全长编码区利用PCR方法进行扩增后克隆到pET-30a(+)载体,测序验证.[结果]该序列是亚精胺合成酶(SPDS)的同源基因,全长序列为1062 bp,包含完整的编码区190 ～1 062 bp,编码291个氨基酸,在GenBank中,其与粗糙脉孢菌的SPDS基因同源性最高,达88％.理化性质预测其编码蛋白疏水性高;无质体、线粒体等定位序列,不存在跨膜螺旋结构,为非分泌型蛋白.进化树分析结果显示与粗糙脉孢菌同源性最高;PCR扩增及测序结果证实目的基因成功克隆进入pET-30a(+)质粒.[结论]获得申克孢子丝菌SPDS的基因及蛋白结构、功能特点,构建了其重组表达质粒,将为进一步明确其在孢子丝菌病中的致病作用奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄怀球	中山大学附属第三医院皮肤性病科	81	406	10.0	17.0
2	袁立燕	中山大学附属第三医院皮肤性病科	8	12	2.0	2.0
3	张静	中山大学孙逸仙纪念医院皮肤性病科	58	216	8.0	11.0
4	张晓辉		16	42	3.0	6.0
5	冯佩英	中山大学附属第三医院皮肤性病科	69	265	9.0	14.0
6	李玉哲	中山大学附属第三医院皮肤性病科	8	11	2.0	3.0
7	高文超	中山大学中山医学院	6	5	2.0	2.0
8	黄丽林	中山大学附属第三医院皮肤性病科	3	2	1.0	1.0