申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析

• 作者: 刘佳庆 吴晓雁 孙瑶 张静 旷翠娥 李玉哲 李美荣 胡南 高文超 黄丽林 黄家敏 黄怀球
• 来源期刊: 皮肤性病诊疗学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 申克孢子丝菌 海藻糖磷酸合成酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 325-329
• 页数: 5页
• 分类号: R756
• 字数: 2987字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8468.2018.06.002

摘要

目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能.方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征.结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸.TargetP和Motif Scan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点.TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽.结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物.