申克孢子丝菌chs1基因生物信息分析

• 作者: 何泰龙 孙瑶 尹颂超 张云青 张静 李美荣 高文超 黄丽林 黄家敏 黄怀球
• 来源期刊: 皮肤性病诊疗学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 申克孢子丝菌 chs1基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 238-242
• 页数: 5页
• 分类号: R756
• 字数: 2745字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8468.2017.04.004

摘要

目的:对申克孢子丝菌几丁质合成酶基因(chs1)及其编码蛋白的结构和特性进行分析和预测.方法:利用NCBI网站、ExPASy和CBS等工具预测申克孢子丝菌chs1基因及编码蛋白的结构和功能.结果:chs1 mRNA全长2 745 bp,编码914个氨基酸.BLAST分析显示,申克孢子丝菌与巴西孢子丝菌、蓝菌属真菌、足马杜拉分枝菌等真菌chs氨基酸序列一致性达到99％,且有保守域.预测chs1蛋白相对分子量为102 714.7,理论等电点为6.71.预测chs1编码蛋白α螺旋、β折叠、β转角、无规则卷的比例分别是38.40％、17.94％、10.39％、33.26％.chs1蛋白是一种疏水蛋白,包含9个跨膜区,未发现信号肽.结论:成功预测了chs1基因及编码蛋白质的生化性质及结构特征,为下一步对其进行克隆、表达和敲除奠定基础.