两株传染性造血器官坏死病病毒的分离及其糖蛋白基因序列分析

• 作者: 何俊强 余剑敏 兰文升 刘荭 史秀杰 康林 张朋 杜娟 申斯思 肖启明 贾鹏 郑晓聪
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 传染性造血器官坏死病病毒 糖蛋白 同源性 进化分析
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 37-41
• 页数: 5页
• 分类号: S941.414
• 字数: 3827字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2012.01.022

摘要

对所分离编号为20101008和20101032的两株传染性造血器官坏死病病毒（IHNV）的糖蛋白编码基因进行遗传进化分析,以揭示我国毒株与其他不同国家和地区毒株间的遗传进化关系。以反转录RCR（RT-PCR）法扩增其糖蛋白（G）编码基因,然后克隆入PMD-18T载体并测序。应用DNAStar和MEGA4.0软件,将20101008和20101032的G基因与多株GenBank中已发表的IHNV毒株相应基因进行比较。结果表明两株病毒间G编码基因的核苷酸和推导出来的氨基酸同源性分别为98%和81.9%,其氨基酸序列分别发生了35和20处氨基酸的替换。20101008和20101032与日本、韩国分离株同源性较高,核苷酸及推导出来的氨基酸同源性分别为93.3%～96.4%和75.9%～84.6%;两株病毒在进化关系上亲缘关系最近,属于同一分支,均为基因U型传染性造血器官坏死病病毒,但其G基因的核苷酸序列以及推导出来的氨基酸序列与已知的基因U型IHNV都有一定的差异。