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摘要:
目的 分析结核分枝杆菌(MTB)北京型菌株及非北京型菌株5个有明显差异的MTB散在分布重复单位(MIRU)位点,研究其多态性与下游基因表达的关系.方法 利用生物信息学方法预测5个MIRU位点(ETR-C、Mtub-30、Mtub-39、MIRU-27、MIRU-40)下游相邻基因启动子区域.通过PCR方法扩增该区域并与分枝杆菌启动子探针载体pMC210连接,重组质粒测序正确后,用电穿孔方法转化耻垢分枝杆菌mc2155.采用Real-Time PCR技术检测报告基因lacZ的转录水平,验证MIRU位点多态性对其下游基因表达的影响.结果 Mtub-39位点核心区域内含有其下游基因的启动子.成功构建了分别带有1、3、5个拷贝重复序列的Mtub-39位点的重组质粒.Real-Time PCR结果显示,有多态性的Mtub-39位点(pMC210-Mtub-39-N158、pMC210-Mtub-39-N139及pMC210-Mtub-39-N146)对报告基因lacZ的转录调控差异有统计学意义(P=0.006 5).结论 Mtub-39位点的多态性能明显影响下游基因启动子的活性进而调节其表达.
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文献信息
篇名 结核分枝杆菌Mtub-39位点多态性与下游基因表达关系的研究
来源期刊 上海交通大学学报(医学版) 学科 医学
关键词 结核分枝杆菌 MTB散在分布重复单位位点 pMC210 启动子
年,卷(期) 2012,(11) 所属期刊栏目 专题报道病原微生物学
研究方向 页码范围 1415-1420
页数 6页 分类号 R378.911|Q786
字数 4854字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-8115.2012.11.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 姚玉峰 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室 28 72 6.0 7.0
2 吴兴福 苏州市第五人民医院检验科 12 55 5.0 7.0
3 周爱萍 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室 7 11 2.0 3.0
5 孙青 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室 10 38 3.0 5.0
8 徐志弘 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室 3 7 1.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
结核分枝杆菌
MTB散在分布重复单位位点
pMC210
启动子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
上海交通大学学报(医学版)
月刊
1674-8115
31-2045/R
大16开
上海市重庆南路280号
1981
chi
出版文献量(篇)
7490
总下载数(次)
12
总被引数(次)
41931
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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