生物信息学法分析猪带绦虫苹果酸脱氢酶结构与功能

• 作者: 廖兴江 戴佳琳 蓝磊 黄江
• 来源期刊: 贵阳医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 猪带绦虫 苹果酸脱氢酶 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4
• 分类号: R383.3
• 字数: 3422字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2707.2012.01.001

摘要

目的:分析和预测猪带绦虫苹果酸脱氢酶的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究.方法:利用美国国家生物技术信息中心和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的工具,结合Pcgene和Vector NTI suite生物信息学分析软件包,从猪带绦虫全长cDNA质粒文库中识别苹果酸脱氢酶基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等.结果:该基因编码332个氨基酸,为全长基因.GenBank中与细粒棘球绦虫苹果酸脱氢酶序列同源性最高,理论分子量为36459.2 Da.预测编码蛋白无跨膜区,无二硫键,稳定性较好.与吸虫属的苹果酸脱氢酶进化关系最近.结论:应用生物信息方法从猪带绦虫成虫Cd-NA文库中筛选出了猪带绦虫核糖体Cdna全长序列并预测得到其结构与功能方面信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄江	贵阳医学院法医学教研室	76	329	11.0	14.0
2	蓝磊		3	6	2.0	2.0
3	廖兴江	贵阳医学院物理学教研室	46	215	8.0	12.0
4	戴佳琳	贵阳医学院法医学教研室	38	96	5.0	7.0