刚地弓形虫苹果酸脱氢酶基因编码蛋白主要特性与抗原表位的生物信息学分析

• 作者: 刘宜升 刘转转 杨燕萍 郑葵阳
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 刚地弓形虫 苹果酸脱氢酶 生物信息学 抗原表位 免疫原性
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 472-475
• 页数: 4页
• 分类号: R382
• 字数: 3103字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2013.05.010

摘要

目的 用生物信息学方法分析刚地弓形虫苹果酸脱氢酶(TgMDH)基因编码蛋白的结构与抗原表位,预测该蛋白的免疫原性.方法 利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、TMPRED、HNN、MotifScan和NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息学在线分析程序,结合Gene Runner和DNAMAN等生物信息学软件,分析并预测TgMDH蛋白的开放阅读框、理化性质、可溶性、信号肽、跨膜区、表面可及性、可塑性、亲(疏)水性、翻译后修饰位点、二级结构及抗原表位,通过CPHmodels程序预测该蛋白的三维空间结构.结果 TgMDH蛋白由316个氨基酸组成,分子式为C1498H2454N402O440S20,分子质量单位为33 777.5,等电点为6.01,波长280 nm时的吸光度(A)值为0.364,半衰期为30 h,有9个表面可及性参数≥1.9的区域、4个亲水性参数得分≥1.9的区域、7个柔韧性参数得分≥2的区域、14个翻译后修饰位点和14个潜在抗原表位,为可溶性表达蛋白.结论 TgMDH基因编码蛋白为可溶性蛋白,有多个抗原表位,具有免疫原性,可作为弓形虫病疫苗候选抗原.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑葵阳		74	215	8.0	10.0
2	刘宜升		23	65	4.0	7.0
3	刘转转		14	37	4.0	4.0
4	杨燕萍		6	53	3.0	6.0