不同物种NF-κB1基因编码区生物信息分析

• 作者: 任玉红 周荣艳 张军杰 李兰会 李祥龙 赵驻军
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 物种 NF-κB1基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 页码范围: 1404-1408,1412
• 分类号: S813|S852.2
• 语种: 中文

摘要

为了解不同物种NF-κB1基因编码区（CDS）的遗传变异,本试验使用生物信息学的方法比较分析了小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、狨、毛猩猩、猕猴、家马、大熊猫、野猪、家短尾负鼠、牛、狼、非洲象和白颊长臂猿NF-κB1基因编码区的遗传多样性,并对该基因的氨基酸序列、跨膜结构域、导肽、信号肽和结构域进行了预测和分析,对有关NF-κB1基因功能的一些研究热点进行了回顾。结果表明：在15个物种36条基因序列中共检测到968个多态位点,生成24种单倍型,NF-κB1基因序列编码区在物种间存在丰富的遗传多样性;理论等电点均低于5.5,NF-κB1编码的蛋白呈酸性,N端无信号肽、导肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性;这些蛋白均含有1个Rel同源域,6～7个Ankyrin重复,在结构上保守。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵驻军	河北农业大学动物科技学院	31	169	8.0	12.0
2	李兰会	河北农业大学动物科技学院	120	583	13.0	17.0
3	李祥龙	河北农业大学动物科技学院	65	311	9.0	14.0
4	周荣艳	河北农业大学动物科技学院	105	307	9.0	11.0
5	任玉红	河北农业大学动物科技学院	12	58	2.0	7.0
6	张军杰	河北农业大学动物科技学院	5	7	1.0	2.0