不同物种Mitf基因编码区生物信息学分析

• 作者: 周荣艳 张丽英 李兰会 李祥龙 杨清芳
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: Mitf基因 编码区 物种 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（22）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 13298-13300,13308
• 分类号: S132
• 字数: 3314字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2011.22.017

摘要

[目的]对不同物种Mitf基因编码区(CDS)进行生物信息学分析.[方法]采用生物信息学方法分析了小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、狨、毛猩猩、猕猴、家马、大熊猫、野猪、原鸡和非洲爪蟾Mitf基因编码区的遗传多样性,并对Mitf氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构和结构域进行预测和推断.[结果]在12个物种的37条Mitf基因CDS序列中,共检测到466个多态位点,生成16种单倍型,Mitf基因序列编码区在种内及种间存在丰富的遗传多样性；Mitf蛋白理论等电点均低于7,呈酸性,N端无信号肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性；蛋白质二级结构的主要元件为α-螺旋和无规则卷曲,有2个保守结构域.[结论]该研究为探明Mitf基因在不同种间和神内的遗传分化,进而为相关黑色素基因的遗传学和进化分析奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李兰会	河北农业大学动物科技学院	120	583	13.0	17.0
2	李祥龙	河北农业大学动物科技学院	65	311	9.0	14.0
3	周荣艳	河北农业大学动物科技学院	105	307	9.0	11.0
4	张丽英	河北农业大学动物科技学院	7	24	2.0	4.0
5	杨清芳	河北农业大学动物科技学院	2	21	2.0	2.0