白额纵沟纽虫(Lineus alborostratus Takakura)的线粒体基因组

• 作者: 孙世春 徐冬丽 时伟 陈海霞
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 纽形动物门 白额纵沟纽虫 线粒体基因组 密码子使用 tRNA二级结构
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 85-92
• 分类号: Q953
• 字数: 4478字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2012.06.014

摘要

通过PCR扩增、测序获得白额纵沟纽虫线粒体基因组全序列并进行了生物信息学分析.白额纵沟纽虫线粒体基因组全长15 476bp,包含后生动物线粒体基因组典型的13个蛋白质编码基因、22个转运RNA基因、2个核糖体RNA基因和1个747bp的非编码区.除tRNA-Thr和tRNA-Pro基因外,其他基因均编码在重链上.基因组碱基组成具有AT偏向性,蛋白质编码基因偏好使用富含T的密码子.蛋白质编码基因的起始密码子均为ATG,终止密码子多为TAA或TAG,nad1、nad2、cytb基因具有不完全终止密码子T.预测的22个tRNA均具有典型三叶草结构.非编码区未发现在其他纽虫所报道的特殊茎环结构,但在nad4基因上发现有37 bp的发卡结构.白额纵沟纽虫的基因排列、起始密码子、tRNA反密码子与Lineus viridis完全一致,两者rrnL和非编码区长度差别较大,前者具有较少核苷酸插入.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙世春	中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所	20	296	7.0	17.0
2	徐冬丽	中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所	1	2	1.0	1.0
3	陈海霞	中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所	5	24	3.0	4.0
4	时伟	中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所	2	4	2.0	2.0