牛病毒性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆及其B细胞抗原表位的预测

• 作者: 何延华 王新华 薄新文 钟发刚 陈南颖 韩猛立 黄新
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 牛病毒性腹泻病毒 结构蛋白 B细胞表位 二级结构 反向疫苗学
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 310-317
• 分类号: S852.65+3
• 字数: 4873字
• 语种: 中文
• DOI: CNKI:65-1097/S.20120302.2238.012

摘要

[目的]以免疫信息学和反向疫苗学为理论根据,应用生物信息学相关软件和方法,对BVDV结构蛋白( Structural Protein,SP)的二级结构的不同方面及其B细胞表位进行了预测,综合评价了BVDV结构蛋白的抗原特异性细胞表位,并计算出一些潜在的抗原位点.[方法]利用RT- PCR扩增法获得牛病毒性腹泻病毒结构蛋白序列,通过克隆、测序分析结构蛋白基因的基因组序列和蛋白序列,采用DNAStar Protean软件对结构蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行综合分析,并预测其B细胞的抗原表位分布.[结果]P14、gp48和gp53蛋白含有的细胞优势抗原表位较多,有的甚至有可能成为优势抗原表位或对优势抗原表位有协同作用.[结论]与已鉴定的B细胞抗原表位相比,试验所用方法预测的结果有较高的准确度,是一种较为先进的表位研究方法.