桔小实蝇电压门控钠离子通道基因cDNA克隆及其生物信息学分析

• 作者: 王进军 申光茂 蒋玄赵 豆威 魏丹丹
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 桔小实蝇 钠离子通道 基因克隆 生物信息学分析 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2012,（19）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 3996-4003
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.19.011

摘要

[目的]克隆获得桔小实蝇(Bactrocera dorsalis)电压门控钠离子通道基因cDNA序列,明确其典型特征,为研究桔小实蝇抗性分子机理奠定基础.[方法]采用RT-PCR和PCR技术,克隆桔小实蝇钠离子通道基因cDNA序列,利用相关软件对其序列进行生物信息学分析.[结果]克隆得到1条长为6 446 bp的cDNA序列,包含1个6 405 bp的完整开放阅读框,共编码2 134个氨基酸.同源比对发现,桔小实蝇与果蝇(Drosophila melanogaster,NP_001188635)和家蝇(Musca domestica,AAB47604)钠离子通道基因相似度分别高达91.7％和86.9％,而与人的钠离子通道Nav1.2基因(Homo sapiens,NP_066287)相似度为42.3％.所克隆序列包含昆虫钠离子通道所有典型特征.[结论]成功地从桔小实蝇中克隆得到钠离子通道基因完整开放阅读框.该钠离子通道基因存在丰富的选择性剪接,发现了3个可能与抗性相关的碱基取代.钠离子通道基因有可能发展成为一种昆虫系统发育研究的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王进军	西南大学植物保护学院昆虫学及害虫控制工程重庆市市级重点实验室	131	1530	22.0	30.0
2	魏丹丹	西南大学植物保护学院昆虫学及害虫控制工程重庆市市级重点实验室	7	53	4.0	7.0
3	蒋玄赵	西南大学植物保护学院昆虫学及害虫控制工程重庆市市级重点实验室	2	10	2.0	2.0
4	申光茂	西南大学植物保护学院昆虫学及害虫控制工程重庆市市级重点实验室	5	26	3.0	5.0
5	豆威	西南大学植物保护学院昆虫学及害虫控制工程重庆市市级重点实验室	17	145	8.0	11.0