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苎麻与大麻 CesA1基因的生物信息学分析
苎麻与大麻 CesA1基因的生物信息学分析
作者:
喻春明
熊和平
王延周
陈平
陈继康
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
纤维素合成酶
苎麻
大麻
生物信息学分析
摘要:
本文利用生物信息学方法从转录组测序数据库中分离了苎麻纤维素合成酶CesA1(BnCesA1)基因全长编码区序列( NCBI 登录号: KC112993),并与大麻纤维素合成酶(CsCesA1)进行了氨基酸组成成分、理化性质以及二级结构比较,构建了CesA1基因家族的进化树。结果显示BnCesA1由3249个碱基组成,编码1082个氨基酸组成的蛋白, CsCesA1由3198个碱基组成,编码1065个氨基酸组成的蛋白。它们是疏水性脂溶蛋白,都含有6个跨膜区,二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主,存在小部分β-转角或扩展链。两基因的核酸序列同源性为86%,氨基酸序列同源性为93%。本文结果为麻类作物纤维素合成酶基因的进一步功能分析提供了基础。
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文献信息
篇名
苎麻与大麻 CesA1基因的生物信息学分析
来源期刊
中国麻业科学
学科
农学
关键词
纤维素合成酶
苎麻
大麻
生物信息学分析
年,卷(期)
2013,(3)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
118-121,154
页数
5页
分类号
S563.1
字数
2785字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
熊和平
中国农业科学院麻类研究所
91
692
15.0
22.0
2
喻春明
中国农业科学院麻类研究所
59
478
12.0
19.0
3
王延周
中国农业科学院麻类研究所
55
419
10.0
18.0
4
陈平
中国农业科学院麻类研究所
44
189
6.0
12.0
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陈继康
中国农业科学院麻类研究所
44
135
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生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国麻业科学
主办单位:
中国农业科学院麻类研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-3532
CN:
43-1467/S
开本:
大16开
出版地:
湖南省长沙市咸嘉湖西路348号
邮发代号:
42-283
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
1639
总下载数(次)
0
总被引数(次)
9829
相关基金
国家科技支撑计划
英文译名:
官方网址:
http://kjzc.jhgl.org/
项目类型:
重大项目
学科类型:
能源
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