湖北地区人源与猪源戊型肝炎病毒部分基因序列的分析

• 作者: 刘小桂 宋爱京 李秀记 樊金萍 王佑春 赵晨燕
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 戊型肝炎病毒 套式RT-PCR 基因型 猪
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 27-31
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文

摘要

目的 调查湖北地区戊型肝炎病毒(HEV)人源与猪源基因型的流行情况.方法 用套式RT-PCR方法对湖北地区25例急性戊型肝炎患者血清和33份用实时荧光RT-PCR检测为HEV核酸阳性的猪血清进行HEV RNA检测.HEV核酸使用QIAamp Viral RNA Mini Kit (QIAGEN)提取,用AMV Reverse Transcriptase (Promega)进行逆转录合成cDNA,所用扩增引物为基于HEV ORF2区域的简并引物,并对阳性产物进行克隆测序,对所得序列进行同源性比较和进化树分析.结果 用RT PCR从25份急性戊型肝炎患者血清和33份猪血清中分别检出HEV RNA阳性者9份和8份.序列分析显示17株戊型肝炎病毒株在ORF2部分区域的核苷酸序列同源性为82％～100％,氨基酸同源性为87％～100％.该17株戊型肝炎病毒序列与HEV 4型代表株的核苷酸序列的同源性为82％～94％,均为HEV 4型,而且人源和猪源HEV均分为相同的4个亚型.进化树分析显示该17株戊型肝炎病毒株分属于4个不同的亚型分支.结论 湖北地区人与猪群中流行的HEV基因型以及亚型相同.