利用支持向量机预测G蛋白偶联受体中潜在的药物靶点

• 作者: 张世强 王春丽
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: G蛋白偶联受体 支持向量机 药物靶点 分类器
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 461-467
• 页数: 7页
• 分类号: Q81
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2013.30033

摘要

在已知的药物靶点中,G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)占绝大多数,它与高血压、哮喘、疼痛、神经和免疫紊乱等多种疾病有着密切联系.但由于GPCR的七次跨膜构象较复杂,其空间结构很难从实验中获取,因此,它们的功能就更难确定了.作者通过对已知蛋白质数据库中数据的分析,构建了两个不同的数据集,并利用蛋白质一级结构、基本理化性质及拓扑描述等特征,训练两组SVM分类器,预测GPCR中潜在的药物靶点.综合分析两组分类器的结果发现,其中有141个GPCR同时被这两组分类器预测为药物靶点.在这141个GPCR中,有39个同时存在于TTD数据库中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张世强		20	167	5.0	12.0
2	王春丽		1	0	0.0	0.0