基于聚类的蛋白质一级结构与三级结构关联研究

• 作者: 闫庆华 陈绮
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质结构预测 K均值聚类 关联规则
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 349-352
• 页数: 4页
• 分类号: TTP3
• 字数: 2574字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2013.03.019

摘要

为了建立蛋白质一级结构与三维结构间的关联规则,以蛋白质数据库PDB为数据源,采用K均值聚类方法对蛋白质二级结构中α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲的疏水值、偶极矩、解离常数3种属性值序列进行分析.结果表明:80％的螺旋和85％的beta折叠都表现出了自身应有的规律,说明聚类分析方法在蛋白质三级结构预测研究中的合理性和有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈绮	海南大学信息科学技术学院	11	93	3.0	9.0
2	闫庆华	海南大学信息科学技术学院	1	2	1.0	1.0