直系同源基因的识别方法与数据库

• 作者: 杨婧 汪晓阳 黄原
• 来源期刊: 生命科学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 直系同源 直系同源识别 数据库
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究进展与综述
• 页码范围: 274-277
• 页数: 4页
• 分类号: Q953
• 字数: 3489字
• 语种: 中文

摘要

直系同源(orthology)是指由于物种形成事件而享有共同祖先的基因之间的关系,直系同源基因之间通常具有相似的结构和生物学功能.由于基因组和转录组序列的快速积累,精确的识别直系同源基因有助于功能基因的注释,比较和进化基因组学研究.综述了现有的识别直系同源基因的主要方法,并列举了由此构建的数据库.这些方法可以归纳为三大类,第一类是基于序列相似性的方法,具有识别速度快以及灵敏度高等优点；第二类是基于构建系统发育树的方法,具有准确性高和信息量大等优点；第三类是将上述两种方法结合起来的混合方法,更好地平衡了灵敏性和准确性.最后总结了识别过程所面临的问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄原	陕西师范大学生命科学学院	84	847	16.0	24.0
2	杨婧	陕西师范大学生命科学学院	7	24	2.0	4.0
3	汪晓阳	陕西师范大学生命科学学院	2	18	2.0	2.0