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摘要:
直系同源(orthology)是指由于物种形成事件而享有共同祖先的基因之间的关系,直系同源基因之间通常具有相似的结构和生物学功能.由于基因组和转录组序列的快速积累,精确的识别直系同源基因有助于功能基因的注释,比较和进化基因组学研究.综述了现有的识别直系同源基因的主要方法,并列举了由此构建的数据库.这些方法可以归纳为三大类,第一类是基于序列相似性的方法,具有识别速度快以及灵敏度高等优点;第二类是基于构建系统发育树的方法,具有准确性高和信息量大等优点;第三类是将上述两种方法结合起来的混合方法,更好地平衡了灵敏性和准确性.最后总结了识别过程所面临的问题.
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文献信息
篇名 直系同源基因的识别方法与数据库
来源期刊 生命科学研究 学科 生物学
关键词 直系同源 直系同源识别 数据库
年,卷(期) 2013,(3) 所属期刊栏目 研究进展与综述
研究方向 页码范围 274-277
页数 4页 分类号 Q953
字数 3489字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 黄原 陕西师范大学生命科学学院 84 847 16.0 24.0
2 杨婧 陕西师范大学生命科学学院 7 24 2.0 4.0
3 汪晓阳 陕西师范大学生命科学学院 2 18 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
直系同源
直系同源识别
数据库
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生命科学研究
双月刊
1007-7847
43-1266/Q
大16开
湖南省长沙市湖南师范大学生命科学院
42-172
1997
chi
出版文献量(篇)
1935
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3
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12834
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