基因集分析方法统计理论探讨

• 作者: 侯国强 张威 张扬 曹文君 李运明 陈长生
• 来源期刊: 中国卫生统计
• 关键词: 微阵列数据 基因集方法 统计理论 Monte Carlo模拟
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 484-486
• 页数: 3页
• 字数: 3032字
• 语种: 中文

摘要

目的 从统计理论角度探讨基因集分析方法,初步建立微阵列数据基因集统计分析理论框架.方法 采用计算机模拟技术,比较不同原假设、理论分布生成方法在进行基因集分析时的统计学性质.结果 自限性原假设方法ROC曲线下面积AUC为0.858.而竞争性原假设方法曲线下面积AUC为0.512.相同设定条件下,bootstrap方法的错误发现率(最高为0.015)低于permutation检验(最高为0.075)；而permutation方法的检验效能(0.89)优于bootstrap法(0.67).结论 有效的基因集分析方法应在正确使用生物学注释基因的基础上,建立自限性原假设、采用基因表达水平标准化值构建基因集统计量并根据需求利用有效的随机化算法构建统计量的理论分布进行推断.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈长生	第四军医大学军事预防医学院卫生统计学教研室	98	718	15.0	20.0
2	张扬	第四军医大学军事预防医学院卫生统计学教研室	37	172	7.0	11.0
3	曹文君	山西省长治医学院基础部	8	31	4.0	5.0
4	侯国强		3	17	2.0	3.0
5	张威	第四军医大学军事预防医学院卫生统计学教研室	11	25	2.0	4.0
6	李运明		1	1	1.0	1.0