中间球海胆Y-box基因分子特性和表达分析

• 作者: 常亚青 张丙龙 田燚 董萍萍
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 海胆 Y-box基因 克隆 表达
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 376-389
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2013.38308

摘要

为获得Y-box蛋白在中间球海胆的生物学功能,实验克隆了中间球海胆Y-box基因的全长cDNA,并进行了定量表达模式分析.Y-box基因全长cDNA为2 425 bp,该序列具有一个81 bp的5’非编码区,1 348 bp 3’非编码区,ORF为996 bp,cDNA编码331个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子质量为37.4 ku,理论等电点是8.55,属于亲水性蛋白.中间球海胆Y-box前体蛋白的氨基酸序列包含3个结构域:氨基酸N末端,亲水结构域C末端和冷休克结构域(cold shock domain CSD),其中CSD区为Y-box蛋白家族中保守结构域.海胆Y-box蛋白质二级结构中无规则卷曲占88.22％,延伸链占9.97％,α-螺旋1.98％,无β-折叠.氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性为22.37％～41.26％,在保守结构域CSD区同源性达到75％以上.实时定量PCR检测,Y-box基因在中间球海胆体腔液、管足、围口膜、雄性性腺、雌性性腺、肌肉和肠7个不同组织中均有表达,但差异不显著.温度胁迫下,中间球海胆Y-box基因的表达均表现为下调,并且随着温度的升高,Y-box基因的表达量呈现逐渐下降的趋势.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常亚青	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点开放实验室	142	766	15.0	19.0
2	田燚	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点开放实验室	17	69	5.0	7.0
3	张丙龙	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点开放实验室	2	6	2.0	2.0
4	董萍萍	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点开放实验室	1	2	1.0	1.0