虹鳟冷休克蛋白Y-box基因的cDNA全长克隆与序列分析

• 作者: 付玉洁 张丽丽 李代宗 李绍明 王家庆 马爽
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 虹鳟 冷休克蛋白 Y-box基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 153-159
• 分类号: Q38|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/j.issn.1000-2030.2014.02.025

摘要

采用逆转录PCR(RT-PCR)及cDNA末端快速扩增(RACE)技术从虹鳟(Oncorhynchus mykiss)脑组织中克隆了Y-box 基因cDNA全长序列(GenBank登录号:FJ492962).该基因cDNA全长为1 452 bp,其中5 '端非翻译区(5'UTR)长137 bp,3'端非翻译区(3'UTR)长409 bp,开放阅读框(ORF)长906 bp,编码301个氨基酸.蛋白质相对分子质量为33.1×103.PSORTⅡ亚细胞定位显示该蛋白位于细胞核,富含两类核定位信号,分别为pat4与pat7.虹鳟的Y-box蛋白序列与大西洋鲑、斑马鱼和大菱鲆的同源性分别为99％、80％和79％.同源建模显示虹鳟与人的Y-box蛋白具有十分相似的三级结构.系统发育树显示不同物种的Y-box蛋白分为3个亚群:亚群Ⅰ为鱼类;亚群Ⅱ为两栖类、鸟类及哺乳类;亚群Ⅲ为节肢动物类,这与物种间的进化历程基本一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李代宗	河北农业大学海洋学院	15	33	3.0	5.0
2	张丽丽	沈阳农业大学科学技术学院	8	30	4.0	5.0
3	马爽	沈阳工学院生命工程学院	21	55	4.0	7.0
4	王家庆	沈阳工学院生命工程学院	33	69	5.0	7.0
5	付玉洁	沈阳工学院生命工程学院	22	15	3.0	3.0
6	李绍明	沈阳工学院生命工程学院	7	13	2.0	3.0