基于松属不同树种EST序列的马尾松SSR引物开发

• 作者: 何卫龙 季孔庶 王晓锋
• 来源期刊: 湖南林业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 松属 马尾松 EST SSR
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 14-17,64
• 页数: 5页
• 分类号: S791.248
• 字数: 4122字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-5710.2013.01.004

摘要

利用松属5个树种的EST序列,分别树种查找SSR位点,采用Primer3.0软件进行引物设计.设计的5个树种的EST-SSR引物中:所占比例最高的均为三核苷酸重复,其次是六核苷酸重复,两者之和都达到了64％以上；四核苷酸重复所占比例均为最低.从设计的引物中分别不同树种各选取20对进行引物合成和通用性检测以及马尾松群体检测,结果表明:松属5个树种的EST序列开发的马尾松SSR引物,其在马尾松中的扩增成功率为60％～80％；最高的是辐射松,最低的是海岸松,平均为72％.通用性最好的为辐射松,属内的通用性为94％；属间和科间通用性也分别达到75％和44％.不同树种序列来源的EST-SSR引物,其扩增成功率在10％～30％；最高的是北美短叶松,其次是辐射松,最低的是扭叶松和火炬松；平均为17％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	季孔庶		70	1086	22.0	30.0
2	王晓锋		2	8	2.0	2.0
4	何卫龙		3	12	2.0	3.0