双翅目昆虫线粒体基因组结构特点及其测序通用引物的设计和应用

• 作者: 余果 张乃心 张玉娟 陈斌
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 双翅目 葱蝇 线粒体基因组 基因结构 保守区域 通用引物
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 398-407
• 分类号: Q969
• 语种: 中文

摘要

研究双翅目昆虫线粒体基因组的结构特点,并设计其测序的通用引物,为今后双翅目昆虫线粒体基因组的研究提供参考和依据.利用比较基因组学和生物信息学方法,分析了已经完全测序的26个双翅目昆虫线粒体基因组的结构特点、碱基组成和保守区,并据此设计了双翅目昆虫基因组测序的通用引物.结果表明:双翅目昆虫线粒体基因组长14 503 ～19 517 bp,其结构保守,含有37个编码基因,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA编码基因和2个rRNA编码基因,此外还包含一段长度差异很大的非编码区(AT富含区).基因组内基因排列次序稳定,除个别基因外,其余都与黑腹果蝇Drosophila melanogaster基因排列次序一致.基因组的碱基组成不均衡,AT含量在72.59％ ～85.15％之间,碱基使用存在偏向性,偏好使用AC碱基.全基因组的核苷酸和氨基酸序列保守,共鉴定了11个保守区.在保守区内共设计了26对双翅目线粒体基因组测序通用引物,扩增的目标片段都在1 200 bp以内.将该套通用引物用于葱蝇Delia antiqua线粒体全基因组测序,结果证明其高效、合用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈斌	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	73	290	9.0	15.0
2	张玉娟	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	19	84	5.0	8.0
3	张乃心	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	1	14	1.0	1.0
4	余果	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	2	17	2.0	2.0