鳗鲡属6种鱼类线粒体COⅠ和COⅡ基因序列分析和分类的有效性

• 作者: 岳丽佳 崔忠凯 张晓懿 龚小玲
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鳗鲡属 COⅠ基因序列 COⅡ基因序列 物种鉴定 系统关系
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 524-530
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

对鳗鲡属(Anguilla)的美洲鳗鲡(A.rostrata)、欧洲鳗鲡(A.anguilla)、太平洋双色鳗鲡(A.bicolor pacifica)、花鳗鲡(A.marmorata)、澳洲鳗鲡(A.australis)、日本鳗鲡(A.japonica)6种鱼类54个体COⅠ和COⅡ基因片段中1 179 bp和633 bp的序列特征、分子分类的有效性、以及构建的系统关系进行了比较分析,结果表明:(1)COⅠ和COⅡ基因可变位点、简约信息的百分比分别为17.98％、16.45％和12.16％、10.11％,COⅠ较COⅡ基因的变异率高;(2)两种基因序列均表现出明显的反G偏倚(在COⅠ和COⅡ中G的百分含量分别为18.45％,16.67％);(3)基于COⅠ基因种间遗传距离均高于COⅡ基因,且均大于2％(欧洲鳗鲡和美洲鳗鲡基于COⅡ基因序列的种间遗传距离为1.8％除外),种内遗传距离都小于1％;(4)以两序列构建的系统树,各物种所有个体均形成独立、高支持率单系,但两序列构建的系统关系并不完全一致.由此说明,COⅠ和COⅡ都能对鳗鲡属鱼类进行有效的物种分子鉴定,但在探讨鳗鲡属鱼类系统进化关系上还需要联合其它基因.研究亮点:对鳗鲡属6种鱼类线粒体COⅠ和COⅡ基因序列组成特点、分类有效性进行了比较分析,结果表明COⅡ与COⅠ两者基因序列存在一定的差异性,前者较后者位点变异率低,但COⅡ基因对鳗鲡属(Anguilla)6种鱼类的分子分类也是有效的,这为分子分类提供了新的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龚小玲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	24	123	6.0	10.0
2	崔忠凯	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	4	21	2.0	4.0
3	张晓懿	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	3	19	2.0	3.0
4	岳丽佳	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	6	2.0	2.0