西门塔尔牛肌内和皮下脂肪miRNA表达谱及miR-27b靶基因分析

• 作者: 李惠侠 汪海洋 王根林 郑月 韩兆玉
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 肌内脂肪 差异miRNA 靶基因 信号通路
• 年，卷（期）: 2013,（18）
• 所属期刊栏目: 畜牧?兽医?资源昆虫
• 页码范围: 3894-3900
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.18.020

摘要

[目的]通过分析西门塔尔牛肌内脂肪和皮下脂肪差异表达miRNA，及对重要的候选miRNA-27b进行靶基因预测及相关生物信息学分析，探索miRNA在动物肌内脂肪生长、发育过程中的作用及其调控机制。[方法]利用miRNA微阵列芯片技术对肌内脂肪和皮下脂肪miRNA表达谱进行检测和分析以筛选差异表达miRNA；qRT-PCR方法验证4个在肌内脂肪显著高表达的候选miRNAs；采用Targetscan生物信息学计算方法预测目标miR-27b（对肌内脂肪沉积可能起重要调节作用）的靶基因，并对靶基因进行GO注释描述、富集分析及KEGG富集。[结果]miRNA芯片分析发现肌内脂肪和皮下脂肪共有88个差异表达极显著miRNA（P＜0.01）。候选的4个在肌内脂肪高表达miRNAs（miR-140、miR-145、miR-143、miR-27b）的qRT-PCR检测结果与芯片分析结果具有很好的一致性。KEGG富集显示，目标miR-27b的预测靶基因在MAPK、Wnt、Hedgehog、TGF-beta、GnRH等信号通路中显著富集，其中在MAPK信号通路中富集度最高。[结论]牛肌内脂肪和皮下脂肪组织中确实存在一些差异表达的miRNAs，某些重要的在差异高表达miRNA（如miR-27b）可能以独特的通路（如MAPK信号）来调节牛肌内脂肪的形成过程。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王根林	南京农业大学动物科技学院	137	1731	24.0	36.0
2	韩兆玉	南京农业大学动物科技学院	66	631	14.0	21.0
3	郑月	南京农业大学动物科技学院	6	32	4.0	5.0
4	李惠侠	南京农业大学动物科技学院	13	120	5.0	10.0
5	汪海洋	南京农业大学动物科技学院	1	11	1.0	1.0