基于转录组测序分析西门塔尔牛和安格斯牛脂肪沉积相关基因的差异表达

• 作者: 吴慧光 吴江鸿 王国富 赵伟明 高树新
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛 转录组 肉质性状 实时荧光定量PCR 候选基因
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 693-701
• 页数: 9页
• 分类号: S603.2|S823.9
• 字数: 5795字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.04.011

摘要

肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)的含量和分布是形成牛大理石花纹肉的物质基础.西门塔尔牛(Bos taurus)和安格斯牛(B.taurus)的脂肪沉积能力不同,安格斯牛IMF含量显著高于西门塔尔牛.本研究采用高通量测序技术筛选背膘脂肪沉积相关基因,旨在为西门塔尔牛和安格斯牛脂肪沉积机制研究提供参考依据.以西门塔尔牛和安格斯牛15月龄公牛各3头进行育肥屠宰实验,对屠宰后的胴体进行肉质性状测定.取两个品种牛背膘脂肪组织进行转录组测序和生物信息学分析.结果显示,2个品种牛在粗脂肪、滴水损失、眼肌面积和pH方面差异不显著,西门塔尔牛剪切力显著高于安格斯牛(P<0.01).转录组数据分析结果表明,2个品种的牛在背膘脂肪组织存在1296个差异表达基因,主要富集在代谢、生长、发育等55个功能条目和脂质代谢、碳水化合物代谢、能量代谢等44条代谢通路;根据通路和功能分析,选择丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)、核受体第4亚族A组成员1(nuclear receptor subfamily 4 group A member 1,NR4A1)和同源异型蛋白(prospero related homeobox,PROX1)3个基因,利用实时荧光定量PCR技术进行基因表达量分析.结果显示,安格斯牛背膘脂肪中PROX1和PDK4的相对表达量分别比西门塔尔牛高47％和14％(P<0.01),NR4A1在西门塔尔牛背膘脂肪中相对表达量比安格斯牛高30％(P<0.05).本研究获得的差异表达基因可作为肉牛肉质性状遗传育种改良的候选基因,可为深入探讨背膘脂肪生长发育的遗传机理提供基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高树新	内蒙古民族大学动物科学技术学院	54	330	8.0	17.0
2	王国富	内蒙古民族大学动物科学技术学院	25	146	6.0	11.0
3	吴慧光	内蒙古民族大学动物科学技术学院	16	130	6.0	11.0
5	吴江鸿	内蒙古民族大学动物科学技术学院	3	0	0.0	0.0
6	赵伟明	内蒙古民族大学动物科学技术学院	1	0	0.0	0.0