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摘要:
【目的】基于转录组测序(RNA-Seq)分析白藜芦醇促进努比亚山羊肌内脂肪沉积的机制,以期找到白藜芦醇影响肌内脂肪沉积的候选基因及调控网络。【方法】采用转录组测序技术对饲料中添加600 mg/kg白藜芦醇组山羊的背最长肌和对照组山羊的背最长肌进行分析。利用edgeR软件进行差异基因(Differentially expressed genes,DEGs)筛选[Fold Change≥2,错误发现率(FDR)<0.05],并对DEGs进行GO功能注释和KEGG富集分析。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测P13K-AKT信号通路关键基因及脂肪分化标志基因的表达。【结果】600 mg/kg白藜芦醇组山羊肌内脂肪含量极显著高于对照组(P<0.01,下同)。RNA-Seq结果显示共筛选出399个DEGs,包括328个上调基因及71个下调基因。DEGs共注释到48个条目,主要包括细胞过程、单有机体过程、细胞、绑定和催化活性。KEGG通路富集分析发现,DEGs主要富集到252个通路,主要包括P13K-AKT信号通路、MAPK信号通路、AMPK信号通路等与脂肪代谢相关的通路,从中进一步筛选出可能参与肌内脂肪沉积的基因(IGFBP7和IRX3)。qRT-PCR结果显示,试验组山羊背最长肌P13K-AKT信号通路关键基因(P13K、AKT和MTOR)和脂肪分化标志基因(PPARγ、FAS和CEBPα)的表达量极显著高于对照组。50μmol/L RSV诱导肌细胞8 d后发现,脂滴极显著多于对照组,P13K、AKT、MTOR、PPARγ、FAS和CEBPα的表达量极显著高于对照组。【结论】基于RNA-Seq分析白藜芦醇促进努比亚山羊肌内脂肪沉积的机制,结合其诱导肌细胞成脂分化,猜测白藜芦醇可能通过P13K-AKT信号通路促进努比亚山羊肌内脂肪的沉积。
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文献信息
篇名 基于转录组测序分析白藜芦醇促进山羊肌内脂肪沉积的机制
来源期刊 南方农业学报 学科 农学
关键词 转录组测序 白藜芦醇 山羊 肌内脂肪 P13K-AKT
年,卷(期) 2024,(3) 所属期刊栏目 专题:转录组测序
研究方向 页码范围 41-50
页数 10页 分类号
字数 语种 中文
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转录组测序
白藜芦醇
山羊
肌内脂肪
P13K-AKT
研究起点
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期刊影响力
南方农业学报
月刊
2095-1191
45-1381/S
大16开
1964-01-01
chi
出版文献量(篇)
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