干扰FABP1基因对猪肌内脂肪沉积的影响

• 作者: 熊讯 阮涌 许厚强 贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
• 来源期刊: 南方农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 FABP1基因 脂肪沉积 脂质代谢 转录组测序分析
• 年，卷（期）: 2024,（8）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 266-276
• 页数: 11页
• 语种: 中文

摘要

【目的】探究FABP1基因对猪肌内脂肪细胞生物学功能的影响机制，为进一步研究FABP1对猪肌内脂肪沉积和脂质代谢的调控作用提供参考依据。【方法】将sh-FABP1干扰载体和空载体sh-NC分别转染至香苏杂交猪肌内脂肪细胞中，36 h后收集转染后的肌内脂肪细胞，采用TRIzol?Reagent总RNA提取试剂盒提取总RNA，待样本质检合格后，每个样品制备1μg的RNA总量用于测序。运用生物信息学进行基因表达水平分析（基因表达水平计算、样本间相关性评估）、基因差异表达分析[差异表达基因（DEGs）筛选和统计、DEGs火山图]和功能富集分析（GO富集分析、KEGG富集分析）。最后分别挑选4个上调基因和4个下调基因运用实时荧光定量PCR验证转录组测序数据。【结果】sh-FABP1与sh-NC之间总共筛选出1129个DEGs，与sh-NC组相比，sh-FABP1上调基因有624个，包括PRKAR2A、ACSL5、ELOVL5和MAPK1等；下调基因有505个，包括LPL、FABP3、IGFBP4和OLR1等。对sh-FABP1与sh-NC之间的DEGs进行功能富集分析，KEGG富集发现上调基因主要在细胞周期（Cell cycle）、肿瘤抑制蛋白（p53）和Notch信号通路中富集，下调基因主要富集在过氧化物酶体增殖物激活受体（PPAR）、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路中。GO注释表明，有22个、15个和9个GO术语分别在生物过程（BP）、细胞成分（CC）和分子功能（MF）中显著富集（P<0.05，下同），显示与脂肪沉积相关具有显著差异的GO术语包括生物粘附（Biological adhesion）、生物调节（Biological regulation）、生物过程调节（Regulation of biological process）和代谢过程（Metabolic process）。【结论】FABP1基因可能通过调节LPL、FABP3、IGFBP4和OLR1等相关基因的表达、脂肪沉积和脂质代谢相关通路，从而调节脂质生成和代谢。