热应激奶牛血清miRNA表达谱及miR-181a靶基因分析

• 作者: 李惠侠 王根林 郑月 陈坤琳
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 荷斯坦奶牛 热应激 miRNAs 靶基因 信号通路
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 130-136
• 分类号: S813.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/j.issn.1000-2030.2014.06.019

摘要

通过分析热应激奶牛和正常奶牛血清差异表达miRNA,及对重要的候选miRNA进行靶基因预测及相关生物信息学分析,探索miRNA在荷斯坦奶牛发生热应激过程中的作用及其调控机制.利用miRNA高通量测序技术对奶牛血清中miRNA表达谱进行检测和分析以筛选差异表达miRNA;用RT-qPCR方法验证4个在热应激奶牛血清与正常奶牛血清中显著差异表达的候选miRNAs;采用Targetscan生物信息学计算方法预测目标miR-181a(对应激以及免疫反应可能起重要调节作用)的靶基因,并对靶基因进行GO注释描述、富集分析及KEGG富集.结果表明:miRNA高通量测序分析发现共有52个差异表达极显著miRNA(P＜0.01).候选的4个miRNAs(miR-19a、miR-19b、miR-181a、miR-1246)的RT-qPCR检测结果与测序分析结果具有很好的一致性.GO和KEGG分析结果显示,miR-181a的靶基因与应激反应以及免疫功能密切相关,并且靶基因在B细胞和T细胞受体信号通路中显著富集.结论:在热应激奶牛与正常奶牛血清中存在差异表达的miRNAs,某些重要的miRNA(如miR-181a)可能以独特的通路(如B细胞和T细胞受体信号通路)来调节奶牛热应激的发生过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王根林	南京农业大学动物科技学院	137	1731	24.0	36.0
2	郑月	南京农业大学动物科技学院	6	32	4.0	5.0
3	李惠侠	南京农业大学动物科技学院	13	120	5.0	10.0
4	陈坤琳	南京农业大学动物科技学院	3	8	2.0	2.0